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4.18 Marinoquinoline F

Okanya 等[21]从PWU 25 菌株中分离得到一种新型天然产物Marinoquinoline F(4.34)以及一系列相关化合物。该化合物的结构通过一维核磁共振(¹H NMR、¹³C NMR)及二维核磁共振(HSQC、HMBC、COSY)谱图得以确定。其中,COSY 和HMBC 谱图中共观察到26 个相关信号(详见表4.18)。

教材配图
表4.18 Marinoquinoline F:核磁共振波谱数据
表4.18 Marinoquinoline F:核磁共振波谱数据

Marinoquinoline F 的分子式C₂₀H₁₃N₃O 通过高分辨电喷雾电离质谱(HRESIMS)分析确定,其[M+H]⁺离子峰位于m/z 312.1138(计算值:C₂₀H₁₃N₃O,312.1131)。该分子中骨架原子与氢原子的比例接近2:1,这一特征在复杂天然产物的结构解析中尤为常见(参见第1.2.2节),通常暗示分子不饱和度很高或存在多环结构。

程序自动生成的分子连接图(MCD)如图4.44 所示。

图4.44 Marinoquinoline F:分子连接图(MCD)
图4.44 Marinoquinoline F:分子连接图(MCD)

MCD 概述:

通过MCD 可以观察到¹³C NMR 谱的显著特征:除C 189.01(推测为羰基碳)外,所有碳原子的化学位移均集中在100–140 ppm 的狭窄区间内,这一分布范围表明分子中可能存在多个芳香环或共轭体系。此外,所有碳原子均处于sp²杂化状态,且除C 101.34(fb)外,其他碳原子与相邻杂原子的连接方式均未明确。另外,C 143.23 和C 189.01 未检测到与任何其他原子的相关信号,这进一步增加了结构解析的复杂性。

为应对上述挑战,我们采取优化策略:手动标注C=O 双键,基于C 189.01 的化学位移(δC 189.01),明确其为羰基碳,从而减少结构搜索空间;同时根据¹H NMR 谱中明确的多重性信息(见表4.18 中M(J)列),为相应碳原子设置相邻氢原子数量,进一步缩小候选结构范围。

MCD 检查未发现二维NMR 数据中的任何矛盾,因此启动了严格结构生成程序。在结构生成过程中,计算了¹³C NMR 化学位移,并通过过滤器排除了偏差值d > 4 ppm 的结构。最终结果如下:k = 3,312,184 →32 →12,生成时间tg = 40 分钟。排名前六的结构如图4.45所示。

图4.45 Marinoquinoline F:排名输出文件中的前六种结构
图4.45 Marinoquinoline F:排名输出文件中的前六种结构

排名第一的结构与Marinoquinoline F 的解析结果完全一致,并通过三种¹³C 化学位移预测方法(HOSE 算法、神经网络算法和增量法)得到验证。自动归属的¹³C 化学位移标注在结构4.35 中,进一步确认了其正确性。

教材配图

值得注意的是,排名前六的结构在整体上具有较高的相似性(各结构框右上角标注了Tanimoto 相似性系数),但通过¹³C 化学位移计算,程序能够从中准确筛选出正确结构。这一正确选择是从约330 万生成结构中脱颖而出的,充分展示了计算机辅助结构解析(CASE)方法的高“分辨能力”。

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