咨询方案

3.3 挑战任务3

“未知物”的结构如下:

教材配图

基于StrucEluc 系统的分子式确定通用方法——通过整合标称分子量、特征离子、NMR及IR 数据进行推导——已在先前案例中充分展示。本节将演示如何通过整合实验数据与化学逻辑推导结论,以表格化形式(表3.3)系统推断分子式。

解析未知物结构时,采用了表3.4 所示的¹H NMR、¹³C NMR、HSQC 及HMBC 数据。表中括号内数字表示等价碳原子数量(如C2 (2)),其判定标准为:具有完全相同的¹³C 化学位移与多重性,且所连质子的化学位移也完全一致。

创建分子连接图(MCD)后,手动绘制了高概率存在的SO₂基团(图3.15)。首次结构生成在"严格结构生成模式"下进行,默认禁止杂原子间成键(通过CSB 生成器选项窗口勾选相应约束)。此约束的设定基于以下考量:(1) 杂原子键主要存在于特定类别的有机化合物(如磺酸类);(2) 允许杂原子键将产生大量无化学意义的结构,显著增加计算耗时;(3) 若后续13C 化学位移预测显示平均偏差过大,则提示可能误禁了必要的杂原子键。通过勾选或取消勾选CSB Generator Options 窗口中的复选框(如下图所示),可动态控制这些约束条件。

表3.3 挑战3:推断分子式
表3.3挑战3:推断分子式

事实数据结论质谱(MS):[M]⁺ = 172氮原子数量为偶数,nN = 0 或2 或4...质谱(MS):[M+2] = 174 (5.1%)可能存在硫(S)

质谱(MS):Δ = 172 - 108 = 64二氧化硫(SO2)非常可能质谱(MS):Δ = 172 - 156 = 16可能存在氨(NH2)

红外光谱(IR):3478, 3376, 3269 cm⁻¹可能存在肼(NH2)、氨基(NH)或羟基(OH)

红外光谱(IR):无CN 或NO2 吸收特征CN、NO2 不太可能存在红外光谱(IR):1597, 1505 cm⁻¹可能存在苯环碳-13C:观察到4 个信号碳原子的最小数量为4碳-13C 和氢-1H氢原子的最小数量为8原子数量范围C (4–6), H (8–10), O (2–5), N (0–4), S (1)

生成的分子式C6H8N2O2S

表3.4挑战任务3:核磁共振(NMR)光谱数据
表3.4 挑战任务3:核磁共振(NMR)光谱数据
图3.15 挑战3:分子连接图。手动绘制了一个SO2 官能团
图3.15挑战3:分子连接图。手动绘制了一个SO2官能团

在启用上述选项的情况下,结构生成结果如下:k = 1,tg = 0.005 秒。唯一生成的结构3.6 的化学位移偏差范围为20-24 ppm,最大偏差达55 ppm。

教材配图

显然,结构3.6 是错误的,因为其平均偏差和最大偏差均显著超出合理范围。随后,勾选了“允许杂原子间成键”选项并重新运行结构生成,结果如下:k = 6 →6 →3,tg = 0.005秒。排名后的输出文件如图3.16 所示,其中正确结构(3.7)被明确确立(对比结构#1 与#2的计算偏差即可验证)。

教材配图
图3.16 挑战任务3:允许杂原子间成键时的排名输出文件
图3.16挑战任务3:允许杂原子间成键时的排名输出文件

值得注意的是,当系统忽略HMBC 谱数据时,仍获得相同最终解析结果:候选结构数量从k=12 经两步筛选稳定至3 个,总生成时间仅需0.01 秒。这一现象源于分子结构的小型化特征——有限的原子数目使得HSQC 及常规NMR 数据已具备足够的结构约束力。

本案例中,质谱数据(MS)成功揭示了O=S=O 基团的存在,而该基团在NMR 谱中并无直接识别特征。尽管如此,CASE 智能解析方法展现了其独特优势:无需依赖额外结构信息提示,仅通过系统化枚举硫(S)和氮(N)的价态组合,结合化学合理性约束,即可实现含O=S=O 分子的精准解析。

初始分子连接图(MCD)经多次迭代构建,在允许硫(S)和氮(N)原子价态自由枚举的条件下运行结构生成程序。为主动排除热力学不稳定结构,系统将O–N–O、O–O–N 及O–O 三类亚结构设为禁阻模式,对应的示例分子OH–NH–OH、OH–O–NH₂和OH–OH 被加入用户自定义黑名单。结果如下:生成结构数量:11,057 →4,567 →2,330,总耗时(tg)= 8秒。通过13C NMR 化学位移预测与结构排序分析,结构1 因其化学位移与实验数据高度匹配被确定为最优解。需要特别说明的是,生成结果中存在大量因硫、氮原子非合理价态组合导致的无效结构(如违反原子成键规律的五价硫或超配位氮构型),这些无意义组合在筛选过程中已被自动剔除。

需要就具体化合物的解析路径做评估,可提供谱图与结构信息,我们协助判断 CASE 是否适用、还需要补哪些实验数据。联系我们