多厂商质谱数据如何统一处理？MS Workbook Suite 能力全景

整理自凯美科公众号质谱数据处理

实验室里的质谱数据往往来自不同厂商的仪器，格式各异、处理流程不一。MS Workbook Suite 是用于质谱数据处理的一体化软件包：在一个界面中完成 MS、LC/MS 和 GC/MS 数据的导入、处理、组分定性、定量与数据库管理，让多仪器数据"进得来、理得清、查得到"。

这套软件能做什么？

• 处理使用任何供应商仪器的 MS、LC/MS 和 GC/MS 数据；
• 自动注释峰并将其与化合物结构关联；
• 对谱图进行去卷积并在数据库中搜索谱图来识别未知物；
• 生成光谱数据库，易于知识共享和搜索。

产品优势

同一软件完成所有质谱数据处理——六个方面的能力共同构成这一优势：

自动注释质谱

自动注释分子、碎片和加合物离子峰，帮助用户更好地了解光谱数据和样品。

识别复杂样品中的化合物

只需点击两次即可解卷积 LC/MS 和 GC/MS 光谱；通过搜索商业数据库和专有数据库来识别已知化合物或推测未知化合物。

化合物定性

增强对结构归属的信心：将预测的碎片离子与实验光谱进行比较，并高亮显示匹配程度。

将质谱和化学联系起来

不要丢失数据的相关信息。将谱峰与结构联系起来，这样当您以后返回文件时，马上就能知道当时查看的是什么。

建立自己的数据库

将组织的所有数据构建成数据库，无论这些数据是在什么仪器上收集的。每个人都可以找到并重复使用以前的工作，并判断新的未知物是否与以前的化合物匹配。

标准工作流程：六步

1. 从任意主流供应商仪器导入 MS、LC/MS 和 GC/MS 数据；
2. 只需点击两次即可将 TIC 解卷积为 XIC；
3. 自动将光谱峰归属给预测的质量碎片；
4. 自动注释质谱以标记分子和加合物峰；
5. 在光谱数据库中搜索任何未知成分；
6. 报告结果并将其上传到共享数据库。

产品功能详解：六大模块

一、样品表征和未知物鉴定

• 解卷积 LC/MS 和 GC/MS 总离子色谱图：IntelliXtract 算法采用独特的 ion-thread 技术来获取组分信息，自动将组分质谱图与每个提取峰关联，检测痕量浓度的成分并区分共洗脱峰；
• 使用 IntelliTarget 算法筛选已知化合物：即使在低浓度或复杂样品中也能识别预期成分；
• 使用智能组分识别工作流程识别"已知"未知物：检索目标数据库包括自有数据库或商业数据库（例如 Wiley、NIST），通过颜色编码显示匹配质量（理论同位素模式与实验数据的一致性），并生成离子质荷比的分子式；
• 组分表总览：在成分表中查看样品成分完整列表，包括每种化合物的保留时间、质荷比、结构（如有）、质谱图、碎片离子、检索命中质量指标等。

二、数据导入与处理

• 导入所有主流仪器供应商格式的文件；
• 自动标识色谱峰，自动标峰或手动标峰；
• 将化学结构归属给色谱峰（结构不明确时以马库什结构标识）；
• 为光谱特征峰添加标签，例如同位素、加合物、多聚体、碎片等；
• 从总离子色谱图中提取平均光谱，或从一个质谱图中减去另一个质谱图，以消除背景信号；
• 分析中性丢失数据、生成中性丢失光谱、检索具有固定质量差值的 MS 峰；
• 根据分子式模拟质谱图，模拟质谱图符合化合物同位素类型；
• 通过宏自动执行常规数据处理工作。

三、LC/UV/MS 数据的定量

根据 TIC（化合物质量）、DAD（自动提取波长）或色谱图（特定波长）对 LC/UV/MS 数据中的组分定量。定量工具通过线性回归提供曲线拟合，支持：

• 同时定量多种化合物；
• 处理重复样本；
• 绘制误差线表示的平均值和标准差；
• 构建标准曲线后定量未知物含量；
• 创建包含标准曲线、化合物元数据、摘要表、统计表、方差分析表和峰值表的可定制报告；
• 自动将标准曲线数据和样本数据文件添加到数据库。

四、MS 碎片预测

• 根据已发表的文献规则预测 MS 碎裂途径，最多支持 255 个非氢原子分子的碎片预测；
• 通过多种过滤选项获得针对实验量身定制的结果，过滤依据包括：正电离或负电离模式、常见碎裂反应（共振反应、成环反应和氢转移反应）、离子形成方式（氢转移、双键断裂、三键断裂、饱和环断裂）、断裂键的类型（烯丙基、非芳香族、C-杂环芳香族、C-杂环）以及氢重排、骨架重排、氧丢失和中性丢失；
• 以碎片树形图查看结果，回顾预测规则以了解碎片化机制；
• 将预测的碎片结构归属给实验光谱中的峰。

五、数据库、报告和集成

• 创建完全可搜索的活谱图数据库，其中包含光谱、色谱图、光谱归属结果、注释、文本信息等；
• 链接相关文档（.docx、.xlsx、.pptx、.pdf、.txt）；
• 按光谱、方法、结构和文本参数搜索数据库；
• 存储搜索历史记录，以便在多个数据库中重新进行搜索；
• 使用脚本自定义数据库功能；
• 将数据和分析导出为可定制的报告。

六、多技术数据处理和分析

• 通过并排查看来自不同技术的数据来增强对分析结果的理解；
• 导入 NMR、IR 等数据并进行分析：NMR 支持傅里叶变换、校准、标峰、积分和多重峰分析；光谱谱图支持校正基线、标峰和平滑曲线；
• 自动化基本处理工作流程。

兼容您的所有仪器和技术

实验室可能拥有多家制造商的 MS 仪器，这还不包括 NMR、IR 和其他分析设备。作为供应商无关化学软件领域的领导者，ACD/Labs 与数十家供应商合作，支持 150 多种文件类型和数千种仪器——可以使用所需的设备，而不必担心数据格式多种多样。

为什么选择第三方软件进行 MS 处理？

MS 数据来自多种仪器，每种仪器各有优势：有些更适合目标物定量，有些更适合高分辨率分析，有些更适合快速且低成本的全扫描。这些数据通常分散存储在不同仪器工作站中，利用效率不高。在统一界面中处理数据可以帮助您：

• 对所有数据应用相同的处理工作流程，保持一致性；
• 对所有数据使用相同的表征和碎片预测工具；
• 轻松切换不同仪器采集数据，无需重新适应不同的界面和选项；
• 让实验室适应未来发展，更换仪器也无需重新调整分析工作流程；
• 将所有光谱添加到一个可搜索的数据库中，加快未来的样品表征；
• 以原始格式将数据整合到数据库中，随时查找和重新处理任何文件；
• 将 MS 数据与用于表征样品的所有其他分析数据相连接。

MS Workbook Suite 2024 版新功能

• 支持多电荷离子碎裂，更适合大分子分析；
• 提高关联型数据谱峰积分面积的准确性；
• 定量分析改进：空白背景扣除、标准曲线标定样品量以及远程数据库功能；
• 更快地处理含有更多目标组分的数据。

本文整理自凯美科公众号文章，配图取自原文。原文中的二维码、联系方式与推广信息已按站内统一规范移除。