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Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建
Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

  在前面三期,我们主要介绍了ACD/Structure Elucidator Suite软件在化合物结构鉴定中的应用,包括核磁谱图数据库、核磁谱图预测以及综合谱图智能解析三个不同的应用层面。今天小编要给大家介绍的功能---数据库构建功能相对独立。对天然产物化学研究领域而言,有效地把已有的化学实验数据(尤其是化学结构、原始谱图文件等)进行电子化储存、管理,无疑对后续的实验有很大的帮助,如实现结构排重、避免重复实验、快速查询数据等。从实验室管理的角度而言,对不同实验人员产生的实验数据电子化储存的规范化、统一化也尤为重要,有利于科研数据的有效积累,形成实验室内部的知识库。

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

ACD/Labs数据库管理功能介绍

基本功能介绍

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建


支持的数据类型:

  • 化学结构(兼容主流的画图软件格式)

  • 化学反应

  • 谱图信息(核磁、质谱、色谱、紫外、红外等)

  • 兼容主流的分析仪器产生的原始文件(如上图示)

  • 生物及毒性信息

  • 描述性文本记录

  • 批次及项目编号附件(doc、xls、ppt、pdf、txt 等)

搜索功能:

  • 化学结构(精确结构、子结构、相似结构)

  • Markush 结构

  • 峰信息、谱图或其他光谱或色谱参数

  • 文本或数值信息

  • 分子量或其范围

  • 谱图搜索功能(峰信号、精确谱图、相似谱图)

数据库模板示例

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

数据库界面示例,存储化学结构、谱图、参数等信息

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

         存储化学反应式、反应条件等

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

谱图搜索,给出相似谱图及相似度

       ACD/Labs构建的数据库可以将化学、分析数据信息保存在一个有机关联的数据库中。科学家可以将化学结构、混合物或化学反应信息及与其相关的“活的”光谱和色谱结果、元数据及链接等整合在一个数据库环境下。

应用案例

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

案例1:构建化学谱图数据库实现真菌次生代谢产物的化学结构排重

文献来源:High-Resolution MS, MS/MS, and UV Database of Fungal Secondary Metabolites as a Dereplication Protocol for Bioactive Natural Products. 

J. Nat. Prod., 2013, 76 (9), pp 1709–1716.

详情链接:https://www.doc88.com/p-08039788190984.html

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

案例2:基于ACD/Labs综合解决方案的天然产物结构排重

文献来源:Targeted Dereplication of Microbial Natural Products by High Resolution MS and Predicted LC Retention Time.

J. Nat. Prod. 2017, 80, 1370−1377.

详情链接:https://www.doc88.com/p-50559400294324.html

Structure Elucidator Suite 专题介绍(四):数据库构建

案例3: LC-HRMS数据库技术快速发现结构新颖的海洋天然产物

文献来源:LC-HRMS-Database Screening Metrics for Rapid Prioritization of Samples to Accelerate the Discovery of Structurally New Natural Products.

J. Nat. Prod. 2019, 82, 2, 211-220.

详情链接:https://www.doc88.com/p-18147388572601.html