基于文献断裂规则的质谱碎片裂解预测软件。绘制化合物结构，选择电离模式与碎裂参数，数秒内生成完整碎片树；支持正/负离子模式与多种离子源，可将预测碎片与实验谱图比对以确认化合物身份，并一键生成可用于发表的裂解途径报告。
两段操作演示：碎片离子预测，以及质谱自动归属验证。
碎片离子预测演示
质谱自动归属验证演示
覆盖从文献规则预测、多维筛选、谱图比对到碎片树展示、报告导出与多技术数据处理的全流程能力。
MS Fragmenter 的典型工作界面截图。
面向质谱结构确证与裂解机制研究中的三类典型需求。
仅凭保留时间或分子量难以确证化合物。MS Fragmenter 将预测碎片与实验谱峰逐一匹配，为结构确认提供裂解层面的证据——实际操作中，实验谱图的 m/z 270.00、213.00、57.00 等主要峰均可由碎片树对应归属，几分钟内完成结构确认。
手工应用断裂规则、收集谱图证据工作量大且难以复用。软件基于文献规则在数秒内生成完整碎片树，覆盖 McLafferty 重排等常见机制，并可查看预测规则了解碎片背后的机理，帮助科研人员真正"读懂"谱图。
裂解途径图的绘制、排版与标准化耗时费力。多种报告模式一键导出，模板可自行编辑，从特定碎片分支到完整碎裂途径均可直接成图，满足分析报告与期刊投稿的规范要求。
| 输入数据 | 化学结构（绘图工具绘制、词典选择或复制/粘贴）；实验质谱图（用于比对与归属） |
|---|---|
| 兼容仪器 / 格式 | 基于 Spectrus 平台读取各主流厂商 MS 数据（150+ 文件类型），覆盖 MS、LC/MS、GC/MS |
| 核心算法 / 方法 | 文献断裂规则库（McLafferty 重排、双键裂解等）；正/负离子模式与 CI、EI、APCI、ESI、FAB 等离子源；共振/成环/氢转移/Distonic-ion 等反应类型；氢重排、骨架重排、氧丢失与中性丢失 |
| 预测规模 | 不超过 255 个非氢原子的分子；支持线性和环肽分子碎裂 |
| 输出能力 | 碎片树（名义质量/单同位素质量/平均质量）；裂解途径报告（Branch/Scheme/Compact/Detailed）；与实验谱图的比对及自动归属结果 |
| 平台协同 | 与 Spectrus Processor 联动实现谱峰自动归属；统一处理 MS、色谱、NMR、光学多技术数据 |
以下应用均在鉴定流程中使用 MS Fragmenter 进行碎片预测与裂解途径验证，并附一篇完整方法学解析实例。
整合肽类特异性碎裂规则，自动指认 a/b/c/x/y/z 离子并联动结构可视化，谱图指认评分由 28.7% 提升至 84.5%，可区分结构异构肽段。
以 COCONUT 与自建苦木成分库检索，联合 MS Fragmenter 碎片预测与 ChromGenius 保留时间预测，经标准品验证阐明抗菌活性成分。
仅凭 NMR+MS 数据解析药物起始原料有关物质：碳谱数据库检索得 12 个候选结构，NMR 信号归属两轮修正，最终由 MS Fragmenter 自动归属验证对称结构。
