含嘌呤和吲哚结构片段化合物的 pKa 计算

整理自凯美科公众号文献验证pKa

嘌呤是自然界中分布最广泛的氮杂环，嘌呤及其相关的吲哚结构是天然产物和药物分子的重要组成片段。pKa 是一个重要的物理化学性质，影响各种重要的化学结果——一种准确估计 pKa 值的方法在生物化学和制药应用中非常有用。该文献报道了一种基于量化描述符的 QSAR 方法对含嘌呤和吲哚结构片段的化合物进行 pKa 计算，并比较了 PhysChem Suite 软件的计算结果。

01　评测结果

PhysChem Suite 软件对 31 个含嘌呤和吲哚片段化合物的 pKa 计算值与实验值之间具有非常好的相关性：pKa1 和 pKa2 的 R² 分别达到 0.948 和 0.957。

02　结论

结果表明，PhysChem Suite 软件的 pKa 预测结果绝大部分都与实验数据非常吻合，相关性非常好，可作为评估该类化合物 pKa 值的可信赖工具。

文献来源

J. Mol. Model. (2018) 24:289. doi:10.1007/s00894-018-3892-4