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3 人 NMR 团队支撑 150 名化学家——先正达基于 ASV 的高通量质量控制实践

NMR结构验证农化质量控制NMR Workbook SuiteASV

案例摘要:先正达(Syngenta)位于 Stein 的作物研究中心里,Katharina Gaus 所在的核磁小组仅有 3 名核磁科学家,却需要支持 150 名合成化学家的结构解析与验证需求,同时还要承担 IR、旋光、TGA/DSC 和外部分析任务。团队以 2000 余个「Building Block」的质量分析为核心案例,采用 LC-MS 与 NMR 并行的全样本检测方案,并借助 NMR Workbook Suite 的自动结构验证功能(ASV)开展质量控制。实践表明:ASV 较手动流程可节省约 50% 的时间,按每年约 20,000 个样品估算,每年可节省约 98 天的结构验证时间。

01 工作内容介绍

Katharina 是先正达化学研究部核磁共振小组的三名核磁科学家之一,该部门是位于 Stein 的先正达作物研究中心的一部分。团队主要致力于协助从事合成研究的同事进行结构解析和验证,除 NMR 外,还需支持 IR、旋光、TGA、DSC 和外部分析等多项任务。

对先正达的科学家而言,即便在研发环境中,质量控制(QC)依然至关重要:化学品仓库中存放着不同年份、来源多样的材料,定期开展质量控制可让科研人员安心使用仓库材料;合成新物质时,确保其质量是推进后续实验或作出决策的必要前提;合作项目的材料交换过程中,质量控制同样不可或缺。

在所有这些情况下,质量控制归根结底在于正确验证化学结构。为了尽量减少验证已知结构所花费的时间,Katharina 及其同事依靠 NMR Workbook Suite 中的自动结构验证功能(ASV)开展 QC 工作。

先正达核磁团队主要职责
先正达 NMR 团队主要职责:管理核磁仪器、支持 150 名合成化学家、承担 IR/旋光/TGA/DSC 等多项分析任务

02 为 ASV 选择 NMR 实验

使用 ASV 实施 QC NMR 工作流程的第一步,是确定能够在不影响工作效率的前提下、为软件提供可获取最佳准确性的数据集。团队估计一年内约有 20,000 个样本可用于 ASV,并计算了采集各种 NMR 数据集所需的时间:

获取各种NMR数据集所需的大致时间
表1. 获取各种 NMR 数据集所需的大致时间(¹H、¹H+HSQC、¹H+HSQC+HMBC 等组合对比)

由于不可能对所有样本采集完整数据集,团队对两批不同的样本(每批 96 个)测量了完整数据集,然后在 ASV 之前选择性地组合使用这些实验。最终结论:使用 ¹H + HSQC 以及严格的匹配因子(MF)阈值,能在 ASV 中以更短的时间达到与完整数据集相近的准确性。

03 将 ASV 用于 QC 的实践

对化学仓库中的 2000 多种材料进行质量检查是一项艰巨的任务。为了覆盖各种类别的样品,团队同时使用 LC-MS 和 NMR 数据来验证结构:以 96 个为一组同时制备样品,然后分别用两种分析技术进行检测。

  • LC/MS 侧——使用仪器软件对 LC/MS 数据自动处理和分析,找到预期质量数时样品标记为通过,并根据 DAD 验证样品的近似纯度,排除纯度较低的材料;
  • NMR 侧——使用 NMR Workbook Suite 自动处理和分析 NMR 数据,并针对所使用的数据集优化了 ASV 设置;
  • 结果汇总——使用 Spectrus 数据库中能根据 MF 阈值显示不同颜色的模块,快速查看哪些样本通过、哪些不明确或未通过。

两种技术的分数分开计算,因此一种方法失效不会影响整体结果。两种检测都表明预期结构通过,则结构总体通过;未能同时通过的样本,手动检验数据是最高效的复核方式。

化学品仓库高通量质量控制工作流程
图1. 用于化学品仓库的高通量质量控制工作流程(LC-MS 与 NMR 并行检测)

04 使用 ASV 可以节省多少时间?

对于该项目的核磁共振部分,团队查看了 2000 多个样本的结果分布,以评估 ASV 的效率:

  • 约 45% 通过,无需人工分析;
  • 约 45% 需要 5–10 分钟的人工再处理;
  • 约 10% 需要 10–60 分钟的人工处理、归属或结构解析。
分析一组96个样品所需时间对比
图2. 分析一组 96 个样品所需的时间——使用 vs 不使用 ASV(2000 分钟 → 约 875 分钟)

团队还将人工分析一批 96 个样本所需的时间与使用 ASV 所需的时间进行了比较:即使手动处理数据的时间只需要 10 分钟左右,使用 ASV 也将 NMR 专家消耗的时间减少了近一半。

在需要 NMR 专家高度关注的 10% 样品中,大多数样品与预期结构不符,需要解析并验证正确的结构。不过在团队看来,直接处理掉这些样品甚至可以节省更多时间——因为很明显,这些样品并非他们打算存放在化学品仓库中的东西。

05 先正达 ASV 的未来潜力

Katharina 和她的同事目前正在考虑将 ASV 应用到其他可以从中受益的工作流程。结合平均每个样品节省约 7 分钟、每年约 20,000 个样品的估计值,如果这些样品全部使用 ASV 进行分析,每年可能节省 98 天的结构验证时间。随着 ASV 不断发展出处理更复杂验证任务的能力(例如包含旋转和非对映异构体的混合物,或含 NMR 不可见官能团的样品),节省的时间还会进一步增加。

凯美科提示:NMR Workbook Suite 的自动结构验证(ASV)已在先正达、诺华、Amgen 等国际药企/农化企业的日常质量控制中大规模落地。如您所在实验室也面临大批量样品的结构验证压力,欢迎联系我们了解 ASV 方案与工作流落地建议。

参考资料

  • Katharina Gaus(Syngenta). High-throughput QC with Automated Structure Verification. ACD/Labs 用户案例。
  • 本文整理自微信公众号「凯美科」发布的客户案例文章。
  • 关键技术:NMR Workbook Suite(ASV 自动结构验证、¹H+HSQC 数据集优化、匹配因子 MF 阈值)、Spectrus 数据库结果可视化。

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