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5.23 Protuboxepin A

真菌作为次级代谢产物的丰富来源,在天然产物化学研究中具有重要地位。特别是海洋真菌,由于其独特的生态系统和生存环境,能够产生结构新颖且具有显著生物活性的次级代谢产物,成为药物开发的重要资源。在这一背景下,Lee 等[26]对海洋来源真菌Aspergillus sp. SF-5044 的培养物提取物进行了系统的化学成分研究。通过生物活性导向分离,研究者从中成功分离出一系列新型天然产物,其中包含氧杂䓬环的二酮哌嗪类代谢产物——protuboxepin A(5.46)。

教材配图

基于高分辨电喷雾质谱(HRESIMS)数据([M+H]⁺实测值m/z 378.1824),Protuboxepin A 的分子式被确定为C₂₂H₂₃N₃O₃,该结果与¹H 及¹³C NMR 数据完全吻合。用于结构解析的波谱数据(¹³C、¹H NMR、COSY、HMBC)汇总于表5.23(COSY 数据未在文献[26]中列表,需通过支持材料中的谱图模式确定)。

经微调的分子连接图(MCD)如图5.59 所示。

图5.59 Protuboxepin A 的经过轻微修改的分子连接图(MCD)
图5.59 Protuboxepin A 的经过轻微修改的分子连接图(MCD)
表5.23 Protuboxepin A:光谱核磁共振(NMR)数据
表5.23 Protuboxepin A:光谱核磁共振(NMR)数据

MCD 概述在构建分子连接图(MCD)的过程中,仅对三个碳原子的属性进行了优化:分别为化学位移162.70、164.40 和169.30 的碳原子添加了“ob”标签,表示这些碳原子必须与杂原子相连。对于化学位移为111.4 的浅蓝色碳原子,其属性未作任何修改,除了可能为C(sp²) 外,也可能存在O–C–O 或N–C–O 片段。根据表5.23 中¹H NMR 的多重性数据(M/J 列),对与部分CHn 原子相邻的碳原子所连接的氢原子数量进行了设定。当光标悬停在相应碳原子上时,可查看其连接的氢原子数量。

分子中包含一个可交换质子,如果能够获得样品在CCl₄中的红外光谱(IR)数据,则可以通过IR 光谱区分OH 和NH 官能团。然而,文献[26]中并未提供相关IR 光谱数据,因此尝试采用“模式泛化分析”(generalized portrait)方法来解决这一结构歧义(详见第1.3.2.6节及专著[21])。

为此,我们基于化合物的¹³C NMR 谱图,对ACD 片段库进行了片段搜索,最终筛选出1,029 个片段。随后,执行了以下命令:Structure Elucidation / Advanced / Search Functional Groups。命令执行后,屏幕上按包含特定官能团的片段数量从高到低的顺序,显示了官能团的排序结果。图5.60 展示了排名前20 的结构以及一行(#41–#45)被程序排除的官能团。

图5.60 Protuboxepin A:官能团库中按包含特定亚结构的片段数量降序排列的前位基团展示。末
图5.60 Protuboxepin A:官能团库中按包含特定亚结构的片段数量降序排列的前位基团展示。末

行显示程序归入"BadList"(排除列表)的功能基团前两个官能团是Found Fragments 中出现频率最高的,并被程序推荐纳入User GoodList。由于羰基和仲胺基团均嵌入到仲酰胺基团中(条目3),因此将片段:

教材配图

添加到Structure Elucidator 的User GoodList 中。值得注意的是,在1,029 个片段中,仅有2 个片段包含叔醇官能团(条目14),以及一个片段包含–>CH–OH 基团(条目19),这进一步支持了分子中存在NH(而非OH!)的假设。此外,官能团库的最后一行数据可以作为排除分子中存在酯基的依据。

MCD 检查结果表明,2D NMR 数据中至少包含一个非标准连接,因此启动了模糊结构生成(FSG),参数设置为:m = 1–20,a = 1,“Stop Generation when Structures Generated(生成结构后停止)”,并在结构生成过程中执行¹³C 化学位移预测。结果如下:k = 1,928 →1,tg= 5 分40 秒,生成过程中扩展了35 个连接中的2 个,使用了595 个可能连接组合中的160个,dA = 2.37,dN = 1.82,dI = 3.5。最终生成的结构(5.47)与protuboxepin A 完全一致,其¹³C 化学位移归属及非标准连接(箭头标示)如下图所示。

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因此,采用“generalized portrait” 方法为该问题提供了唯一且正确的解决方案。

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