4.29 Tetrabrominated Diphenyl Ether
Dai 等[32]针对缺氧介导的肿瘤细胞适应、存活及转移扩散机制,开展了小分子抑制剂的研究。他们发现,海绵Lendenfeldia sp.(Spongiidae)的粗提物对缺氧诱导的HIF-1 激活具有显著抑制活性(5 μg mL⁻¹ 浓度下抑制率达99%)。通过对4 g 粗提物的系统分离纯化,获得了两种新化合物及三种已知的同源鳞鲨烷型二倍半萜。其中,新化合物4.58 的结构通过对比文献报道的光谱数据,并结合¹H NMR、¹³C NMR、¹H–¹H COSY、¹H–¹³C HMQC 和¹H–¹³C HMBC 谱图的解析得以鉴定。
基于高分辨电喷雾电离质谱(HRESIMS)数据,推导出化合物4.58 的分子式为C₂₂H₁₈O₆[m/z 378.1105(计算值C₂₂H₁₈O₆:378.1103)]。尽管HRESIMS 数据表明该分子包含22 个碳原子,但作者[32]在¹³C NMR 谱中仅检测到11 个碳信号,因此推测其为对称二聚体。通过HMBC 相关性分析,进一步确认了萘环结构上取代基的定位。然而,文章[32]中未提供完整的2D NMR 数据表,且未通过NMR 谱图预测或X 射线晶体学分析对结构4.58 进行验证。若作者采用常规经验方法进行¹³C 化学位移预测,可能会立即发现该结构存在明显偏差。例如,使用ACD/CNMR 谱图预测软件分析时,得到的平均偏差值显著偏高:dA = 6.72、dN =7.34 和dI = 7.33 ppm。此外,作者报道的红外光谱中1,720 cm⁻¹处的吸收带是羰基伸缩振动的特征峰,但结构4.58 中并未包含C=O 基团。

基于上述结构矛盾,数年后Podlesny 和Kozlowski [33]通过合成化学与多维波谱分析联用策略,确证了化合物4.58 原定结构的错误性。研究团队系统性解析了文献[32]中的原始波谱数据,结合独立研究数据,最终提出具有显著结构差异的修正结构(4.59a 和4.59b)。

4.59a 4.59b结构重新解析对目标化合物的重新研究表明,其¹³C NMR 谱图中实际存在13 个特征峰,而非文献[32]中报道的11 个峰。其中,新增的两个峰与117.4 和150.5 ppm 处的信号存在密切关联。这一显著差异促使研究团队[33] 对该天然产物分离物进行了独立的结构解析。通过(−)-HRESIMS 分析,代谢物显示出含四个溴原子的特征峰簇,结合精确分子量测定,确定其分子式为C₁₃H₈Br₄O₃([M−H]⁻ m/z 526.7119),不饱和度(DBE)为8。值得注意的是,该分子骨架原子数是氢原子数的2.5 倍,表明尽管其结构看似简单,但解析过程仍面临较大挑战(参见第1.2.2 节,Crews 规则)。
用于推断结构4.59a 的一维和二维NMR 光谱数据见表4.29。

1H NMR 谱中观测到较小的耦合常数,与芳香环间位质子的典型耦合特征一致(见表4.29)。COSY 相关分析显示分子内存在两个独立的自旋耦合系统:H2 与H4 耦合,H10与H12 耦合(具体数据详见结构4.59a 及表4.29)。
通过HSQC 及HMBC 数据的综合解析(表4.29),明确该化合物为四溴二苯醚(tetrabrominated diphenyl ether)结构,其甲氧基(OMe)与羟基(OH)分别位于两个苯环上,且每个苯环上各有两个溴取代基。基于上述波谱证据,文献[33]推演出八种可能取代模式的结构(见图4.73)。
![图4.73 四溴二苯醚:作者[33]提出的八种候选结构](assets/img/book/book-4-29/p279_08.webp)
为筛选最可能的结构,文献作者采用CambridgeSoft ChemBioDraw 程序对¹³C 化学位移进行了系统预测。通过将计算结果与代谢物的¹³C NMR 实验数据(表4.29)进行对比,发现结构#1 的匹配度最高,因此确定为该天然产物的最可能结构。
以下展示如何利用Structure Elucidator 软件解决这一结构解析问题。将分子式C₁₃H₈Br₄O₃ 和表4.29 中的光谱数据输入StrucEluc 系统,并构建MCD。基于DBE 值为8的特征,推测所有低场¹³C 化学位移均来源sp²杂化的苯环碳原子,同时确定甲基与氧原子直接相连。将化学位移为146.2、150.6 和150.9 ppm 的碳原子标记为"ob"(表示邻近原子为杂原子)。根据表4.29 中¹H NMR 谱图的信号多重性,设定邻近碳原子上连接的氢原子数(本案例中均为零)。编辑后的MCD 见图4.74。

执行严格结构生成程序,并在生成过程中进行¹³C 化学位移预测,以排除平均偏差值过高的不合理结构。最终获得结构生成结果:k = 26,597 →7 →5,计算时间tg = 1 分18 秒。排名前四的结构见图4.75。

结构#1 以其较低的平均偏差值被确认为最可能的结构,与修正后的结构4.59a 完全一致。其¹³C 化学位移归属结果与结构4.59b 中标注的数据高度吻合,进一步支持了其合理性。
如文献[33]所述,Podlesny 和Kozlowski 对八种含有两个苯环且氢原子以间位孤立形式连接的异构体进行了系统性检查。他们假设这些异构体涵盖了所有满足上述结构特征的可能性。然而,考虑到分子包含两个苯环骨架,一个关键问题随之而来:对于分子式为C₁₃H₈Br₄O₃且氢原子以间位孤立形式连接的化合物,究竟需要检查多少种异构体才能确保筛选出最佳结构?为此,我们在图4.74 所示的MCD 基础上,添加了以下约束条件重新进行结构生成:将苯环结构单元加入GOODLIST(GOOD 窗口),并将每个生成结构中的苯环片段数量设定为两个(在“Properties” 中右键单击“Quantity”,然后左键单击“Edit Property”完成设置)。结果显示,系统共生成12 种结构。这表明,实际需要验证的异构体数量应为12 种(而非8 种),因此作者[33]遗漏了另外4 种含有间位氢原子的潜在结构(见图4.76)。

解决方案中的结构#2 一致值得注意的是,结构#1(图4.76)的平均偏差值表明,其仍应被视为一个具有较高可能性的候选结构。StrucEluc 软件的优势在于能够自动生成并验证完整的结构假设集,这一功能是传统结构解析方法无法实现的。若¹H NMR 谱图中的信号多重性存在模糊性,则可能需要检查包含两个苯环的44 种异构体,而采用传统方法手动生成并分析如此大量的异构体显然是一项极具挑战性的任务。
本案例具有重要的教学意义。它直观展示了一组未经严格验证的“假设”如何导致作者[32]得出错误的结构。这些假设的来源至今仍不明确。例如,为何离子m/z 378.1105 会被误认为分子离子,这一关键性问题尚未得到合理解释。这一教训强调了在结构解析过程中,需对关键数据进行严格验证,并充分运用计算化学工具的重要性。
