理化性质预测软件 PhysChem Suite 功能介绍
Percepta 平台是化合物性质预测工具,在无缝衔接的运行环境下提供包括理化性质、ADME-Tox 性质的准确预测、实验数据库参考、基于性质的先导物优化设计等完整方案。其中理化性质预测软件包 PhysChem Suite 为科学家提供了化合物物理化学性质评估支持,帮助用户快速获得所需参数的详实评估信息。
01 功能简介
PhysChem Suite 包括 logP、pKa、logD、溶解度以及其他物理化学参数的预测功能,并支持用户添加实验数据自建训练集,提高性质预测准确性;提供庞大的实验数据库供用户进行性质快速查询,同时计算界面下提供 5 个相似化合物实验数据供用户参考;并支持化合物性质批量计算功能。
注:带 * 的参数预测模型支持用户添加实验数据,拓展训练集。
软件操作简便,用户只需提交化合物结构式,即可快速、准确地预测其理化性质,交互式的界面展现丰富的参考信息。对于 logP、水溶性等预测模块,软件不仅提供预测结果,还会给出相似化合物的实验数据供用户参考。以下是部分参数的预测结果界面:
logP
logD
pKa
水溶性
批量计算
02 预测准确度评测
有不少第三方单位对 ACD/Labs 的理化性质预测准确性进行了评测并发表了文章。结果显示,相对其他预测模型或软件,ACD/Labs 的准确度均名列前茅。以下是部分评测文章的结果:
pKa 预测准确性评测
文献来源:J. Chem. Inf. Model., 2009, 49 (12), pp 2801–2812
文献来源:Chemosphere, Volume 169, February 2017, Pages 524-533
该文对 88 个头孢类抗生素的 pKa 进行了预测,并将预测值与实验值进行相关性分析:预测值与实验值具有良好的相关性,RMSE 为 0.552。
水溶性预测准确性评测
文献来源:J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 571–581
该文分别通过 Beilstein 数据库 1210 个化合物以及 32 个药物分子,对不同的水溶性预测模型进行了评测。结果显示,ACD/Labs 的水溶性预测模型均表现优秀。
沸点预测评比
文献来源:Environ Toxicol Chem. 2003 Aug;22(8):1696-709.
该文通过 100 个化合物作为测试集,对不同的沸点预测软件进行了评测。结果显示,ACD/Labs 软件的沸点预测准确性最高,平均绝对误差仅为 1℃。
03 文献与数据库的引用情况
PhysChem Suite 的理化性质预测结果得到广大用户的认可,并使用该软件发表了大量文章。下图为通过谷歌学术检索关键词 "acd physchem" 的结果:
另外,权威数据库 SciFinder、ChemSpider 等采用了 ACD/Labs 的预测算法,数据库中的化合物对应的理化性质参数由 ACD/Labs 计算所得,供用户参考。
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