优化 DDA 高分辨数据在 MetaSense 中的处理效率

整理自凯美科公众号方法学参数优化

针对 MetaSense 用户反馈的"DDA 模式采集数据运行时间长、效率低"问题，本文以 AB SCIEX Triple TOF 5600 代谢数据为例，介绍如何通过合理设定软件参数来缩短处理时间。文中案例采用数据依赖型采集（DDA）模式，其他采用 DDA 采集的仪器也可参考本指南。

01　导入与基础设定

打开 MetaSense 主程序界面，设定好样品名和数据，建议先将数据在 Processor 中转成 .spectrus 格式，这样可以减少软件运行时间。设定好 Parent 的保留时间，以及数据分析保留时间区间（注意设定格式，本例设定为 8..25）。Triple TOF 的 MS Accuracy 推荐设定为 0.005 Da。

02　指定采集模式与代谢物列表

点击 Next 进入下一步。通常软件会自动识别仪器种类与采集模式（Instrument Type / Acquisition Type）；若不能正确识别，需在 Acquisition Type 下拉菜单中人工指定为 DDA。外部代谢物列表（External Metabolite List）选择默认的 Percepta 列表，点击对应 option 可设定代谢类型。

03　组分识别算法：ItelliTarget

在 Component Detection Algorithm（组分识别算法）中选择 ItelliTarget。点击其后的 option 进入参数设定：

• 将 Data Analysis Region 中的 Full 改为 false，并在 Start tR 与 End tR 中设定对应的数据分析区间（本例分别为 8 和 25）；
• 在 Peak Picking 栏设定组分的标峰参数，主要可调整 Peak Minimum Height（最小峰高）、Peak S/N Threshold（峰信噪比）与 Peak Area Threshold（最小峰面积阈值）。这三个参数应根据自己数据的实际情况调节——本例将最小峰高阈值设定为最大峰高的 0.1%；
• Smoothing 栏无需调整，不进行平滑处理；
• 在 Target Analysis 栏设定提取组分 MS 谱图的 MS 精度（Mass Accuracy for MC Generation）：高分辨质谱可设定为 0.005 Da；组分分子式吻合度指数 FFQ（Formula Fit Quality Index）设定为 0.5——该指标是所选组分的计算同位素模式与实验同位素模式的"相似性度量"，完全吻合为 1，最不吻合为 0，通常可设定中间值 0.5。

04　高级参数

勾选窗口右侧 Advanced 进入高级参数设定窗口，此处仅需设定一个参数：找到 Mass Accuracy for Peak Labeling，将 Mass Accuracy 设定为 0.005 Da（该参数设定的是 MS 谱图中数值的显示精度）。

05　代谢物确认（Metabolite Confirmation）

勾选主界面右下角 Use Advanced Setting 进入高级参数设定。在 Metabolite Confirmation 栏中，需针对不同的实验类型做相应调整：

• 单点数据：请将 Remove Metabolite With Maximum in T0、Remove Metabolite with Only One Peak、Remove Metabolite with Slow Speed Reaction 与 Remove Metabolite with Significant Fluctuation 调整为 False；
• 多点数据（如孵化实验）：可将上述四个参数调整为 True。

本例为单点实验，故四个参数均为 False。

06　运行

点击 OK 回到主界面，参数设定完成，点击 Run 即可运行。

通过预先转存 .spectrus 格式、限定数据分析区间、合理设定标峰阈值与质量精度，可显著缩短 DDA 高分辨数据的处理时间，提升 MetaSense 的代谢物鉴定通量。

本文整理自凯美科公众号文章，配图取自原文。原文中的二维码、联系方式与推广信息已按站内统一规范移除。